diff --git a/bin/cmmde.py b/bin/cmmde.py index 919ec87..6a901a7 100755 --- a/bin/cmmde.py +++ b/bin/cmmde.py @@ -120,7 +120,7 @@ parser.add_argument('-draco_c','--draco_charges',type=str,default='eeq',help='Pi # Input for the solvator module in Orca6 parser.add_argument('-solvator','--solvator',type=bool,default=False, help='Apakah ingin menggunakan pelarut explisit? Default: False.') parser.add_argument('-nsolv','--nsolv',type=int,default=5, help='Jumlah pelarut yang digunakan dalam model pelarut eksplisit. Default: 5.') -parser.add_argument('-solventfile','--solventfile',type=str,help='File pelarut yang digunakan jika digunakan pelarut yang tidak ada dalam model ALPB.') +parser.add_argument('-solventfile','--solventfile',type=str,default='none',help='File pelarut yang digunakan jika digunakan pelarut yang tidak ada dalam model ALPB.') parser.add_argument('-solvprint','--solvprint',type=str,default='NORMAL',help='Seberapa detail output perhitungan solvator. Default: NORMAL, pilihan: LOW, HIGH.') parser.add_argument('-randomsolv','--randomsolv',type=str, default='True', help='Apakah pelarut diletakkan secara sangat acak? Default: False.') parser.add_argument('-fixsolute','--fixsolute',type=str, default='True',help='Apakah posisi terlarut tidak berubah selama proses solvasi. Default: True.') diff --git a/lib/__pycache__/cmmde_orca.cpython-310.pyc b/lib/__pycache__/cmmde_orca.cpython-310.pyc index f7ab85f..03e279a 100644 Binary files a/lib/__pycache__/cmmde_orca.cpython-310.pyc and b/lib/__pycache__/cmmde_orca.cpython-310.pyc differ diff --git a/lib/cmmde_orca.py b/lib/cmmde_orca.py index 1fadf53..98c76f1 100644 --- a/lib/cmmde_orca.py +++ b/lib/cmmde_orca.py @@ -130,7 +130,8 @@ end print('%SOLVATOR',file=f) print(' NSOLV {}'.format(nsolv),file=f) print(' CLUSTERMODE STOCHASTIC',file=f) - print(""" SOLVENTFILE "{}" """.format(solventfile),file=f) + if solventfile != 'none': + print(""" SOLVENTFILE "{}" """.format(solventfile),file=f) print(' PRINTLEVEL {}'.format(solvprint),file=f) print(' RANDOMSOLV {}'.format(randomsolv),file=f) print(' FIXSOLUTE {}'.format(fixsolute),file=f)