update features for ORCA6

main
Aditya Wibawa Sakti 1 month ago
parent da8871cde3
commit 03ab66ef78
  1. 2
      bin/cmmde.py
  2. BIN
      lib/__pycache__/cmmde_orca.cpython-310.pyc
  3. 3
      lib/cmmde_orca.py

@ -120,7 +120,7 @@ parser.add_argument('-draco_c','--draco_charges',type=str,default='eeq',help='Pi
# Input for the solvator module in Orca6
parser.add_argument('-solvator','--solvator',type=bool,default=False, help='Apakah ingin menggunakan pelarut explisit? Default: False.')
parser.add_argument('-nsolv','--nsolv',type=int,default=5, help='Jumlah pelarut yang digunakan dalam model pelarut eksplisit. Default: 5.')
parser.add_argument('-solventfile','--solventfile',type=str,help='File pelarut yang digunakan jika digunakan pelarut yang tidak ada dalam model ALPB.')
parser.add_argument('-solventfile','--solventfile',type=str,default='none',help='File pelarut yang digunakan jika digunakan pelarut yang tidak ada dalam model ALPB.')
parser.add_argument('-solvprint','--solvprint',type=str,default='NORMAL',help='Seberapa detail output perhitungan solvator. Default: NORMAL, pilihan: LOW, HIGH.')
parser.add_argument('-randomsolv','--randomsolv',type=str, default='True', help='Apakah pelarut diletakkan secara sangat acak? Default: False.')
parser.add_argument('-fixsolute','--fixsolute',type=str, default='True',help='Apakah posisi terlarut tidak berubah selama proses solvasi. Default: True.')

@ -130,7 +130,8 @@ end
print('%SOLVATOR',file=f)
print(' NSOLV {}'.format(nsolv),file=f)
print(' CLUSTERMODE STOCHASTIC',file=f)
print(""" SOLVENTFILE "{}" """.format(solventfile),file=f)
if solventfile != 'none':
print(""" SOLVENTFILE "{}" """.format(solventfile),file=f)
print(' PRINTLEVEL {}'.format(solvprint),file=f)
print(' RANDOMSOLV {}'.format(randomsolv),file=f)
print(' FIXSOLUTE {}'.format(fixsolute),file=f)

Loading…
Cancel
Save